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波動エンジンは、メインノズルと下面の2基のサブノズルにLEDが組み込まれる。段階的に強くなる光と、特徴的な噴射音を再現したサウンドにより、波動エンジンの駆動を再現（音・光再現約18秒）。

ヤマトの印象的なフォルムを形成する船体底部の第三艦橋は、後部のハッチが設定通りに開閉。古代進をはじめとする総勢144名が艦に乗り込む様をイメージできる。

艦橋後方の偵察機や戦闘機を積載する艦載機格納庫は、ハッチ開閉に加え、格納庫内部の点灯ギミックも搭載。

大気圏内を飛ぶ雄姿を再現。大気圏内航行用の主翼は、船体内に３段にたたまれて収納。下部ボタンにより主翼の一部が展開、更に引き出すことで完全な展開状態を再現。
また、主翼の収納時には、船体内部から手動操作でカバーを引上げることで、艦の概観を損ねません。